El juego sitúa al jugador en el papel de Daniel, que despierta en un oscuro castillo sin apenas recuerdos de quién es y su pasado.5 Todo lo que puede recordar es su nombre y que algo está persiguiéndole.6 7
La historia del juego parece estar inspirada, al menos en parte, por el cuento de terror El intruso. Esto tiene sentido considerando los frecuentes homenajes que los desarrolladores hacen a H.P. Lovecraft y sus trabajos. Incluso el motor que utilizan todos los videojuegos de Frictional Games, el HPL Engine, contiene las siglas del escritor.8 Los autores también han citado que se inspiraron en "Soul made Flesh" de Carl Zimmer y películas de terror antiguas como The Haunting: la mansión encantada
El juego empieza cuando el protagonista Henry Townshend experimenta una pesadilla en la que su apartamento está cubierto de sangre y óxido, y un espíritu lo ataca en su sala de estar. Henry ha estado encerrado en su apartamento en South Ashfield, el cuarto 302, durante cinco días, sin manera de comunicarse con el exterior y sufriendo pesadillas similares a esa frecuentemente.18 La puerta está cerrada con candados colocados desde el interior, las ventanas se han vuelto irrompibles y nadie lo puede oír fuera del apartamento. Al inicio del juego, un agujero grande aparece en la pared de su cuarto de baño de forma inexplicable, y Henry entra en él intentando escapar. Desde ese momento entra a una red de agujeros que lo llevan a través de una serie de sueños o «mundos» relacionados con Silent Hill.
El primer destino de Henry es una estación de metro subterránea aparentemente abandonada, donde encuentra a una mujer llamada Cynthia Velázquez, quien está convencida de que está soñando. Henry intenta protegerla y escapar de la estación subterránea, pero al poco tiempo Cynthia se separa de él y Henry es atacado por unas criaturas parecidas a perros. Buscando a Cynthia, el protagonista encuentra otro agujero, y al entrar en él despierta en su apartamento, donde recibe una extraña llamada de ella pidiéndole ayuda. Este hecho hace a Henry dudar de si lo que experimentó fue un sueño o fue real. Al poco tiempo, Cynthia es asesinada por un hombre misterioso. Henry la descubre a punto de morir, con una serie de números grabados en el pecho. Después del asesinato, Henry despierta otra vez en su apartamento y oye en la radio que Cynthia ha muerto en el mundo real.
Lo mismo sucede con las otras tres personas que Henry encuentra cuando se adentra en el agujero. Henry llega a un bosque cerca de un orfanato relacionado con el culto de Silent Hill, donde conoce a Jasper Gein, un muchacho tartamudo que balbucea cosas que, en principio, no tienen sentido. Henry se adentra más hasta toparse con un niño, pero antes de que pueda interrogarlo Jasper interrumpe y el niño se va. La segunda muerte que Henry presencia es la inmolación de Jasper, quien se graba los 5 números característicos en el estómago mientras arde. Después de la muerte de Jasper, el agujero lleva a Henry a una extraña prisión para niños, donde el guardia Andrew DeSalvo está en una celda, de la cual Henry lo libera; al parecer este conoce al pequeño niño, y dice que su nombre es Walter Sullivan. Poco después, Henry encuentra a Andrew ahogado en una celda sucia y con agua. La cuarta víctima es un vecino que vive enfrente de Henry, Richard Braintree, a quien encuentra en un mundo parecido al exterior de su edificio de apartamentos; al final del mundo, Henry encuentra a Richard en una silla eléctrica, con Walter niño señalando un apartamento en la ventana. Los asesinatos se relacionan en el hecho de que los cádaveres de Cynthia, Jasper, Andrew y Richard poseen extraños números en una parte de sus cuerpos, y Henry descubre que ese es el MO del asesino en serie Walter Sullivan.19
En su apartamento, Henry descubre una pequeña grieta que le permite espiar a su vecina, Eileen Galvin. Ella parece estar preocupada por Henry aunque no lo conoce muy bien. Junto con el superintendente del edificio, Frank Sunderland, Eileen trata de contactar con el protagonista, pero no lo puede oír ni percibir de ninguna manera. Sunderland menciona que no es la primera vez que algo así sucede en el apartamento de Henry. El protagonista también empieza a recibir notas por debajo de la puerta, las cuales son fragmentos del diario del dueño anterior del apartamento, Joseph Schreiber, quien estaba investigando los asesinatos de Sullivan.20
El último lugar al cual el agujero del cuarto de baño conduce a Henry es una versión cubierta de sangre y óxido del interior de su edificio de apartamentos, donde halla a un hombre hablando de forma extraña y tratando de entrar en la habitación de Eileen. Cuando Henry logra entrar al apartamento de su vecina la encuentra junto al misterioso niño, fuertemente golpeada y con números grabados en la espalda. Eileen agradece al niño y le dice que debe huir, mientras Henry se inclina ante ella y despierta.
Después del ataque a Eileen, el agujero del baño de Henry se cierra. Él sigue recibiendo notas de Schreiber, las cuales le permiten abrir un nuevo agujero en su cuarto de lavado. Este lo conduce a una dimensión basada en el hospital, donde se encuentra a Eileen. Henry llega a ella y le explica su situación; Eileen no le cree en un comienzo, pero finalmente decide ir con Henry. Él intenta hacer que Eileen regrese al apartamento, pero descubre que ella no puede siquiera ver los agujeros. En ese momento, el protagonista recibe una carta de Schreiber donde explica que lo que sucede está relacionado con el asesino en serie Walter Sullivan, y pide al próximo residente del apartamento, en ese caso Henry, seguir hasta el fondo del mundo de Sullivan.21 Este viaje lleva a Henry y a Eileen a volver a atravesar los mundos donde el protagonista presenció los asesinatos cometidos por Walter. Al mismo tiempo, extraños fenómenos empiezan a invadir el apartamento de Henry, lo que deteriora su condición.
El diario de Schreiber revela que Walter era un huérfano a quien la Orden de Silent Hill adoptó; él creyó que su madre biológica era el apartamento de Henry, porque fue ahí donde descubrieron a Walter abandonado recién nacido. Según las investigaciones de Schreiber, Sullivan está tratando de llevar a cabo un ritual que requiere 21 asesinatos, los «21 Sacramentos», para «purificar» a su «madre», lo que ha causado el deterioro del apartamento de Henry.22 Walter escribe números en sus víctimas para señalar ese ritual. El undécimo sacramento fue el mismo Walter, quien se suicidó para poder ser inmortal y llevar a cabo los otros asesinatos tras su muerte.23 Henry descubre que él es la última víctima, el número 21, y Eileen Galvin la número 20.
Finalmente, Henry y Eileen llegan al punto más profundo del mundo de los agujeros, el cual está basado en los recuerdos de Walter. Ese lugar resulta ser la «madre» de Sullivan, el apartamento de Henry. Ahí encuentran el espíritu de Schreiber, quien les dice que el único escape del apartamento es evitar el ritual destruyendo a Sullivan, y da instrucciones sobre cómo hacerlo. Henry entonces entra una vez más en el agujero.24 Henry debe perforar el cuerpo de Walter con la propia carne de Walter para despojarlo de su inmortalidad y así matarlo.
Henry despierta en su apartamento, en el cual descubre un cuarto secreto, donde encuentra el cuerpo de Walter crucificado. En el cadáver, el protagonista adquiere las llaves que abren el candado de la puerta del apartamento, pero al salir de él Henry se vuelve a hallar en el mundo de Walter, lleno de criaturas extrañas y cubierto de sangre, donde se reúne con Eileen. En el cuarto del superintendente, Henry finalmente adquiere el cordón umbilical de Walter, el elemento que necesita para matarlo. En ese momento, Eileen sucumbe a la influencia de Walter y deja a Henry, y él vuelve al apartamento para perforar el cuerpo de Walter, pero encuentra otro agujero, uno lleno de sangre negra. Dentro de él halla una cámara con luz roja y otro agujero extraño que conduce a donde está Eileen, poseída y caminando hacia una trampa mortal, mientras Walter se dirige a Henry y lo ataca. Tras derrotar a Walter, él murmura por última vez «mamá» y el juego muestra uno de los cuatro finales diferentes, los cuales varían si Eileen sobrevive o no a la batalla final y según la condición general del apartamento de Henry.25
Nueve meses después de los acontecimientos de ambos juegos, el Hombre Clave(Point Man) fue capturado por el Personal de Seguridad de Arnacham (Con las voces de Barry Pepper y Lund Mark) e interrogado en un asilo. Paxton Fettel interrumpe el interrogatorio y ayuda a liberar al Hombre Clave, a quién llama “Hermano”. Los dos forman una alianza incómoda y escapan del asilo a través de los barrios pobres.
Comandando un helicóptero, el Hombre Clave y Fettel regresan a Fairport para reagruparse con F.E.A.R., y con el c.operativo Jin Sun-Kwon. Durante su regreso, la población civil que sobrevivió, derivó en que algunos se volvieron locos por la actividad paranormal o bien, fueron ejecutados por personal de Armacham. Luchando a través del camino, los hermanos logran con éxito reunirse con Jin. Jin reproduce las imágenes grabadas en vídeo de Michael Becket, quien reveló su violación por parte de Alma y que está programado para ser transportado por Armacham.
Usando un transporte automatizado, el Hombre Clave y Fettel asaltan el aeropuerto local para interceptar Becket, matando al resto del personal Armacham. Con el fin de obtener más información de Becket, Fettel lo posee y le revela al Hombre Clave la vida pasada de Becket, mientras que éste se da cuenta de la real identidad del Hombre Clave. Cuando Fettel libera a Becket tiene consecuencias fatales que causan una explosión sangrienta. Los hermanos se dirigen a un viejo centro de entrenamiento de Harlan Wade, que servía para estudiar y desarrollar los prototipos, donde ambos empiezan a destruir los elementos asociados a los recuerdos de su niñez pasada, con el fin de causar daños en el eco persistente de Harlan Wade conocido como The Creep. Poco después de la destrucción de la monstruosa aparición de Wade, uno de los dos finales, es posible, dependiendo de múltiples factores. Para un solo jugador, un final del bien y el mal se produce en función de si el jugador ha controlado al Hombre Clave o a Fettel. Por otra parte, si se juega en co-op (equipo), el jugador con la puntuación más alta, determina el final. El final mostrará a Point Man sobreponiéndose a Fettel y viceversa, con el final en función de si el Point Man ó Fettel han sobrevivido a la lucha final.
En el final de Point Man, éste le ha dado a Paxton tres tiros en la cabeza tres veces, y viendo que su cuerpo de manera espontánea se quema. Luego, a medida que se acerca a Alma, a punto de terminar el trabajo de parto, se da cuenta de que su bebé ha nacido. Luego el cuerpo de Alma desaparece, mientras que recibe una transmisión de Jin de que todo ha terminado, dándole las gracias por sus esfuerzos. Con el bebé en el hueco de su brazo izquierdo, que sale de la habitación.
En el final de Paxton Fettel, Paxton posee el cuerpo del Hombre Clave diciendo No tenía porque ser así hermano y de alguna manera logra extraer el bebé del cuerpo hinchado de Alma. Él promete
Cuenta la historia de un pueblo japonés, All God, aislado del resto del mundo. En este pueblo se solía hacer una serie de sacrificios humanos para no enfadar al abismo sagrado, en el que, supuestamente, habitaba un gran poder maléfico. Uno de los sacrificios (el ritual carmesí), fue el de los gemelos Itsuki y Mitsuki, salió mal, por lo que Ryokan Kurosawa, el patriarca de la aldea, decide que en el siguiente Ritual carmesí participaran sus dos hijas gemelas Yae y Sae, pero a Yae le horrorizaba la idea del ritual y tras convencer a su hermana Sae, deciden huir al mundo exterior. Logran salir del pueblo con la ayuda de Itsuki, pero mientras huyen por la senda que les llevará al exterior Sae tropieza y cae en un terraplen, y su hermana Yae no se da cuenta, por lo que sigue adelante dejando a Sae atrás, en manos de los fanáticos habitantes del pueblo.
Los aldeanos no saben que hacer, ya que solo tienen a Sae y necesitan a su hermana gemela también para realizar el Ritual carmesí, pero al final, Ryokan decide hacer el sacrificio de todas formas; los sacerdotes ahorcan a Sae y arrojan su cadáver al abismo sagrado. Pero al realizar el ritual con solo una gemela y de la manera imprevista, el poder maldito del abismo se desata, cubriendo el pueblo con una oscuridad eterna y poseyendo a Sae, que junto con el kusabi (guardián del abismo) acaban con todos los habitantes del pueblo y condenan a sus almas a permanecer allí por toda la eternidad, en el desastre conocido como "La Penitencia"
Desde entonces, el pueblo quedó atrapado eternamente en la noche del ritual y el único sonido que se oye, de vez en cuando, es la risa diabólica de Sae. Todo aquel que se adentre en el bosque y cruce la puerta Shinto que marca la entrada del pueblo jamás podrá regresar.
El juego se inicia con una secuencia a modo de introducción en la que muestra los hechos que sucedieron en el primer juego, Dead Space, exponiendo los motivos y acontecimientos por los que el protagonista está en ese lugar y en ese instante en el tiempo. Han pasado tres años desde los incidentes en la colonia minera Aegis 7 e Isaac Clarke ha sido llevado a una ciudadela llamada "El Eje" (The Sprawl), en Titán, una de las lunas de Saturno. Logró salir con vida de la nave USG Ishimura, pero su mente parece haber quedado trastornada por los horrores vividos en la nave y por la influencia de la Efigie (The Marker).
Conforme la historia avanza Isaac va encajando las piezas del rompecabezas y descubre la realidad que ocultan esas instalaciones, así como los motivos por los cuales está ahí.
Estos son los juegos que me an dado cagaso bueno el F.3.A.R no porque lo jugaba online en un ciber pero ahora tengo mi pc y no lo tira porque me falta una placa