Veo que a algunos novatos se les dan instrucciones bastantes largas para un asunto tan simple.
En Ubuntu Normal, es decir con Unity trabajando, solo es dar clic en "LUGARES" ir a "Equipo" y allí escoger la unidad, dar clic derecho y escoger la opción formatear.
En Ubuntu 2D o con el Gnome sin o con efectos ( mi caso es Ubuntu 2D, porque mi tarjeta gráfica no me permite usar Unity).
Solo es cuestión de abrir la Carpeta Personal, (segundo ícono del dock lateral) y en el Menú, buscar "Ir", alli se escoge "Equipo" (y lo mismo) escoger la unidad, dar clic derecho y escoger la opción "formatear".
Espero que les sirva.