Yahiko
Yahiko quedó huérfano durante la Segunda Gran Guerra Shinobi, y, por lo tanto,comenzó a valerse por sí mismo,robando comida de los demás. Más tarde se encontró a Konan,también huérfana,y los dos comenzaron a trabajar juntos para sobrevivir.Después de esto,Konan trajo a otro huérfano,Nagato,y su perro,Chibi. Al principio,Yahiko estaba molesto de que ella estaba trayendo más gente,pero más tarde aceptó a Nagato y Chibi en su banda.Enfurecido por lo injusto que era el mundo con ellos,Yahiko declaró que él se convertiría en un dios para poner fin a los combates.
Los tres encontraron a Jiraiya,que cuido de ellos y les enseñó Ninjutsu.En un momento dado,Nagato salvó a Yahiko después de que un Chunin de Iwagakure los atacara.Después,Yahiko prometió convertirse lo suficientemente fuerte como para proteger a Konan,Nagato y finalmente,a todos en Amegakure.
Algún tiempo después de que Jiraiya los dejo,
los tres se ganaron una reputación como un equipo con talento shinobi.Aún con el deseo de crear un mundo de paz,reunieron a muchos seguidores que compartían su esperanza por un mundo mejor.En conjunto,estos comenzaron a dispersar sus creencias para detener la guerra sin violencia. Lamentablemente,el líder de Amegakure,Hanzō,vio a Yahiko y sus seguidores como una amenaza a su poder.
Trabajando con Danzō, Hanzō intentó obligar a Nagato a matar a Yahiko;si no lo hacía,Konan moriría, por lo que Yahiko se asesino el mismo. Sin dudarlo,Yahiko se lanzó hacia un kunai que Nagato estaba sosteniendo.Con su último aliento,le dijo a su amigo que tenia que continuar su misión de encontrar la paz.
Ataques:
Elemento Agua: Olas Furiosas
Nagato
Hechos relevantes de la serie afirman que Madara le concedio a Nagato el Rinnegan aunque no se sabe como lo hizo. Según Madara, Nagato es un descendiente del clan Uzumaki. Durante la Segunda Guerra Shinobi, Nagato vivía con sus padres en un pueblo cerca de Amegakure. Un día, dos ninjas de Konohagakure irrumpieron en su casa en busca de comida, sin saber que el lugar estaba habitado. Los padres de Nagato, creyendo que iban a ser asesinados, atacaron a los dos ninjas para que Nagato pudiera escapar. Uno de esos ninjas de Konoha mató a sus padres. En su dolor, Nagato despertó su Rinnegan y asesinó a los ninja de Konoha. Consideró este incidente, como el primer gran dolor de su vida.
Después de que su familia muriera, Nagato vagó por el país, yendo de casa en casa pidiendo comida. Con el tiempo encontró a un perro llamado Chibi y más tarde a Konan y Yahiko, quienes comenzaron a viajar con él en su búsqueda de alimento. Un día, Chibi murió por el fuego de la lucha de Hanzō contra los Sannin. Nagato lloró su muerte y se prometió a sí mismo que iba a cambiar el mundo. Cuando la guerra terminó, los tres huérfanos se econtraron con los Sannin. Jiraiya, en lugar de regresar a Konoha junto con sus compañeros, decidió enseñarles a los tres a cuidarse así mismos.
Poco después de que comenzaran a vivir con Jiraiya, Nagato y Yahiko fueron atacados por un ninja de Iwagakure. Nagato involuntariamente reactivó su Rinnegan para defender a Yahiko, matando al ninja invasor. Cuando Jiraiya se entero de esto, decidió enseñarles ninjutsu. Nagato le pidió ayuda a Jiraiya para que pudiera proteger a Konan y Yahiko. La respuesta de Jiraiya para Nagato era crecer y usar sus ojos para encontrar la paz que tanto desea para el mundo. Tres años más tarde, los huérfanos se habían convertido en ninjas competentes, por lo que Jiraiya se vió en la necesidad de regresar a Konoha.
Ataques: Bansho Tenin, Barrera de los Cinco Sellos, Camino Animal, Camino Asura, Camino Deva, Camino Externo, Camino Humano, Camino Naraka, Camino Preta, Chibaku Tensei, Elemento Agua: Explosión de Agua Colisión de Olas (Sólo en el anime), Elemento Agua: Olas Furiosas (Sólo en el anime), Elemento Tierra: Estilo Pared de Tierra (Sólo en el anime), Elemento Viento: Violenta Palma de Viento, Eliminación de Alma, Gedo: Arte Rinne de la Reencarnación, Invocación: Estatua GedoJutsu, Clones de Sombras (Sólo en el anime),Jutsu de Invocación, Jutsu de Invocación Amplificada, Lectura de Mentes, Jutsu Cambio de Forma, Técnica de la Mágica Linterna Corporal, Técnica de Lluvia del Tigre, Técnica de Sellado: Nueve Dragones Ilusorios, Técnica de Sellado: Técnica de Absorción, Jutsu Clon de Sombra, Seis Caminos del Dolor, Shinra Tensei.
Konan
Konan, cuando era niña, quedó huérfana después de la muerte de sus padres a causa de la Segunda Gran Guerra Ninja, entonces ella se une junto a otro huérfano llamado Yahiko para que pudieran sobrevivir juntos. Un día ella se encontró con Nagato tirado en el piso muriendose de hambre, ahí ella le ofrece un pedazo de comida causando que después lo llevara a él y a su mascota (Chibi) al refugio para que se uniera a su noble causa. Después de un tiempo se encontraron con los legendarios Sannin, en donde ellos le piden comida, en el momento en que los shinobis deciden irse, los niños los siguen y Konan les entrega una flor hecha con la envoltura de papel de la comida. Entonces Yahiko les pide a los shinobis que les enseñen ninjutsu, uno de los ninjas llamado Jiraiya se compadece de ellos y decide entrenarlos hasta que pudiesen cuidarse solos. Durante su niñez fue considerada por Jiraiya como la más amable de los tres y reconocida por su excelente manejo con el origami.
Los años pasaron y Jiraiya los dejó después de 3 años por su propia cuenta y los huerfanos llegaron a formar una organización a mando de Yahiko, pero llego un momento en que sus acciones alertan al líder de su aldea ya que quizas ellos podrían derrocar su gobierno. Por eso Hanzo, el lider de Amegakure, utilizó como escusa formar una asociacion con dicho grupo para poder traer la paz a su pueblo, pero resultaba que el día de la reunión, Konan es secuestrada por el Amekage para utilizarla como amenaza si Nagato no mataba a su líder. Aunque ella gritaba que se salvaran ellos, Yahiko se suicida con el kunai que sostenía Nagato; al final es salvada por este, se une a Akatsuki y decide tomar el mando de su pueblo junto con su compañero Pain.
Konan (小南, Konan) era la fiel amiga y compañera de Pain. Tenia un talento natural para el origami. Cabe destacar que ella era el único miembro femenino de Akatsuki.
Ataques:
Danza del Shikigami, Clon de Papel, Shuriken de Papel y Técnica del Ángel de Papel.