Un buen programa para hacer esto es el CrystalDiskMark, ya que es gratuito, ocupa muy poco y es ejecutable (no hay que instalarlo).
Lo podeis descargar de aqui:
http://dl.crystaldew.info/download/CrystalDiskMark21.zip
lo unico que hay que hacer es bajarse el programa, ejecutarlo
Y por supuesto procurar que el ordenador no este haciendo nada cuando se hace la prueba.