El día de ayer me cambié de Ubuntu a Debian , y esta siendo un poco más trabajoso configurar todo porque Ubuntu nos hacía la visa más fácil pero últimamente no encontraba que Ubuntu fuera tan estable como cuando me cambié de Windows a Ubuntu (hace más de cinco años, feliz con el cambio).
Hice mi respaldo de Evolution (Archivo > Respaldo de Configuración o ajustes) y me generó un archivo evolution-backup.tar.gz y bueno pensé que el respaldo era sencillo pero tuve que indagar y hacer algunas pruebas para recuperar mis emalis y configuración.
Lo que hice fue lo siguiente:
1.- Cree un Directorio temporal en mi carpeta de usuario: /home/usuario/Temp
2.- Dentro de la carpeta Temp copié el archivo de respaldo: evolution -backup.tar.gz
Lo pueden hacer todo esto con el Nautilus
3.- Abrí un terminal y me fui a la carpeta Temp: $ cd Temp
4.- Luego desempaquete el archivo desde el terminal:
$ tar xzf evolution -backup.tar.gz
5.- Con Nautilus con la opción Ver > Motrar archivos ocultos, podemos ver dentro del directorio Temp el directorio: .evolution
6.- Desde el Terminal (siempre en el directorio Temp), digitamos:
$ cd .evolution
(el promt será :~/Temp/. evolution $)
$gconftool-2 --shutdown
$evolution --force-shutdown
$tar xzf evolution -backup.tar.gz
$gconftool-2 --unload evolution_setting.xml
$gconftool-2 --load backup-restore-gconf.xml
Esperamos un momento, dependiendo del tamaño de archivo de respaldo, y listo tuve mi cuenta con todos mis correos, carpetas, cuentas, mis diferentes contactos y funcionando tambien como en Ubuntu .
Ahora, no lo he probado pero hacer un respaldo de tu Evolution es mejhor hacer así:
1.- Desde el terminal digitamos:
$evolution --force-shutdown
$gconftool-2 --shutdown
Se necesita hacer un respaldo de los siguientes directorios:
~/. evolution /
~/.gconf/apps/ evolution /
~/.gnome2_private/ Evolution
Crear el archivo de respaldo tar.gz:
$tar -cvzf evolution -backup.tar.gz . evolution .gconf/apps/ evolution .gnome2_private/Evolution
Ojala les sirva y le cueste un poco menos hacer su respaldo. Saludos

Link que me ayudó: