Acaba de salir una nueva versión de HandBrake ( 0.9.3 ), una aplicación multiplataforma desde la cual podemos rippear DVDs a formatos como MP4, MKV, AVI u OGM.
Yo la llevo usando ya algún tiempo con resultados formidables para pasar algunos DVD al formato del iPod Touch.

El programa es muy sencillo de usar ya que viene con unos presets (en la derecha de la ventana) para los formatos más utilizados.
En mi caso, para pasar los DVDs al formato del iPod Touch suelo cambiar la calidad haciendo click en la opción Bitrate y bajándola a 50 lo que me da una buena relación tamaño/calidad logrando archivos más livianos y con una calidad aceptable para poder visualizarlos en la pantallita del iPod.
Podemos instalar o actualizar a HandBrake 0.9.3 con el paquete deb correspondiente:
Una vez instalado lo podemos ejecutar desde Aplicaciones > Sonido y Video > HandBrake .