Existen grandes problemas en el siglo XXI que no han podido ser resueltos por los avances tecnológicos: se trata de enfermedades que, pese al progreso médico, no han encontrado cura todavía, y ya va siendo el momento. Virus como el sida y pesadillas como el cáncer siguen destruyendo vidas día tras día, y aunque podemos retrasar su avance, son incurables por el momento.
Para ganar la batalla a estos poderosos enemigos, los científicos esperan encontrar una proteína que sea capaz de matar al virus, o de detener de raíz un tumor maligno. Pero la búsqueda de ese elixir es larga: se deben probar miles de candidatos, encontrar su estructura química para analizar la reacción con el objeto a tratar y, cuando se halle un buen candidato, probarlo. Aquí es donde intervienes, lector, porque puedes donar la parte que no utilizas de CPU (el procesador casi nunca trabaja al 100%) para invertirlo en este titánico proyecto: tan sólo es necesaria la instalación de un programa (BOINC) que se ocupa de organizar todo el trabajo de computación para aprovechar los recursos inutilizados de tu ordenador y sacarles un notabilísimo partido. BOINC gestiona decenas de proyectos, pero me interesan para este artículo los relacionados con la investigación médica: Rosetta@home y World Community Grid.
Rosetta@home es uno de los referentes en computación por la ciencia. Creado por el laboratorio Baker de la Universidad de Washington, tiene como meta descubrir la estructura de proteínas que podrían servir más tarde como candidatos para tratar el sida y el cáncer, por ejemplo. Las proteínas son las moléculas de la vida, junto con el ADN, y están compuestas por una combinación de 20 aminoácidos diferentes, que se repiten arbitrariamente en cadenas de cien como mínimo. El orden de los aminoácidos en la proteína determina su función, pero ésta no puede saberse si no se conoce su estructura, que es lo que requiere tanto tiempo de computación al depender de muchísimas variables. Colaborando con Rosetta ayudarás a desenmascarar posibles moléculas entre las cuales podría encontrase el elixir de la salvación para millones de personas.
World Community Grid (WCG) utiliza la información de Rosetta@home y analiza la función de las proteínas en relación con sustancias presentes en el virus del sida; por otra parte, en otro de sus subproyectos, examina muestras de tejido canceroso en búsqueda de información relevante para combatirlo.
El proceso para instalar BOINC en nuestro ordenador y comenzar a colaborar con los proyectos es el siguiente:
1. Descarga BOINC.
2. Instálalo en tu ordenador. Se trata de una instalación completamente normal: puedes elegir si quieres que se ejecute al encender el PC, si deseas iconos en el escritorio, etc. Ten en cuenta que en un paso se te pedirá que elijas el tipo de instalación: elige ‘Single-User Installation’.
3. Una vez finalizada la instalación, ejecuta el programa. Se te pedirá que te unas a un proyecto. Haz clic en ‘Siguiente >’.
4. En ‘URL del Proyecto’, copia http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ para Rosetta@home. Haz clic en ‘Siguiente >’.
5. Crea un nuevo usuario. Para ello, introduce tu dirección de email y una contraseña. Haz clic en ‘Siguiente >’ y en ‘Finalizar’.
6. El programa se pondrá en contacto con el proyecto y descargará las primeras unidades de trabajo. No se necesita más mantenimiento. Para hacer lo mismo con World Community Grid, repite los pasos 4 y 5 introduciendo la dirección
http://www.worldcommunitygrid.org/ en el menú Herramientas > Unirse a un nuevo proyecto.
Recomiendo que hagas clic en ‘Advanced View’ en BOINC Manager para tener acceso a más opciones y vistas. Por ejemplo, ve a la pestaña Tareas, selecciona una unidad de trabajo y, a la izquierda, haz clic en ‘Mostrar gráficos’. En Rosetta podrás ver la proteína con la que está trabajando en ese momento tu ordenador; en WCG la molécula del VIH o imágenes del tejido canceroso que trata en ese instante tu PC, dependiendo del subproyecto que haya entonces. Tienes muchas más opciones en BOINC Manager: en el menú Avanzado > Preferencias puedes ajustar parámetros como el máximo de CPU a utilizar, o ver en la pestaña Estadísticas un gráfico de tus progresos: cada unidad de trabajo da una cantidad de “puntos” (con un valor simbólico simplemente) que se van acumulando en tu cuenta.
Realmente me gustaría que, dentro de poco, el trabajo de tantos ordenadores luchando con un mismo objetivo diese su merecido fruto, y que yo pudiera anunciar en este blog el descubrimiento de una vacuna contra estas enfermedades que, por fin, haga que el sacrificio valga la pena.
Fuente
Para ganar la batalla a estos poderosos enemigos, los científicos esperan encontrar una proteína que sea capaz de matar al virus, o de detener de raíz un tumor maligno. Pero la búsqueda de ese elixir es larga: se deben probar miles de candidatos, encontrar su estructura química para analizar la reacción con el objeto a tratar y, cuando se halle un buen candidato, probarlo. Aquí es donde intervienes, lector, porque puedes donar la parte que no utilizas de CPU (el procesador casi nunca trabaja al 100%) para invertirlo en este titánico proyecto: tan sólo es necesaria la instalación de un programa (BOINC) que se ocupa de organizar todo el trabajo de computación para aprovechar los recursos inutilizados de tu ordenador y sacarles un notabilísimo partido. BOINC gestiona decenas de proyectos, pero me interesan para este artículo los relacionados con la investigación médica: Rosetta@home y World Community Grid.
Rosetta@home es uno de los referentes en computación por la ciencia. Creado por el laboratorio Baker de la Universidad de Washington, tiene como meta descubrir la estructura de proteínas que podrían servir más tarde como candidatos para tratar el sida y el cáncer, por ejemplo. Las proteínas son las moléculas de la vida, junto con el ADN, y están compuestas por una combinación de 20 aminoácidos diferentes, que se repiten arbitrariamente en cadenas de cien como mínimo. El orden de los aminoácidos en la proteína determina su función, pero ésta no puede saberse si no se conoce su estructura, que es lo que requiere tanto tiempo de computación al depender de muchísimas variables. Colaborando con Rosetta ayudarás a desenmascarar posibles moléculas entre las cuales podría encontrase el elixir de la salvación para millones de personas.
World Community Grid (WCG) utiliza la información de Rosetta@home y analiza la función de las proteínas en relación con sustancias presentes en el virus del sida; por otra parte, en otro de sus subproyectos, examina muestras de tejido canceroso en búsqueda de información relevante para combatirlo.
El proceso para instalar BOINC en nuestro ordenador y comenzar a colaborar con los proyectos es el siguiente:
1. Descarga BOINC.
2. Instálalo en tu ordenador. Se trata de una instalación completamente normal: puedes elegir si quieres que se ejecute al encender el PC, si deseas iconos en el escritorio, etc. Ten en cuenta que en un paso se te pedirá que elijas el tipo de instalación: elige ‘Single-User Installation’.
3. Una vez finalizada la instalación, ejecuta el programa. Se te pedirá que te unas a un proyecto. Haz clic en ‘Siguiente >’.
4. En ‘URL del Proyecto’, copia http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ para Rosetta@home. Haz clic en ‘Siguiente >’.
5. Crea un nuevo usuario. Para ello, introduce tu dirección de email y una contraseña. Haz clic en ‘Siguiente >’ y en ‘Finalizar’.
6. El programa se pondrá en contacto con el proyecto y descargará las primeras unidades de trabajo. No se necesita más mantenimiento. Para hacer lo mismo con World Community Grid, repite los pasos 4 y 5 introduciendo la dirección
http://www.worldcommunitygrid.org/ en el menú Herramientas > Unirse a un nuevo proyecto.
Recomiendo que hagas clic en ‘Advanced View’ en BOINC Manager para tener acceso a más opciones y vistas. Por ejemplo, ve a la pestaña Tareas, selecciona una unidad de trabajo y, a la izquierda, haz clic en ‘Mostrar gráficos’. En Rosetta podrás ver la proteína con la que está trabajando en ese momento tu ordenador; en WCG la molécula del VIH o imágenes del tejido canceroso que trata en ese instante tu PC, dependiendo del subproyecto que haya entonces. Tienes muchas más opciones en BOINC Manager: en el menú Avanzado > Preferencias puedes ajustar parámetros como el máximo de CPU a utilizar, o ver en la pestaña Estadísticas un gráfico de tus progresos: cada unidad de trabajo da una cantidad de “puntos” (con un valor simbólico simplemente) que se van acumulando en tu cuenta.
Realmente me gustaría que, dentro de poco, el trabajo de tantos ordenadores luchando con un mismo objetivo diese su merecido fruto, y que yo pudiera anunciar en este blog el descubrimiento de una vacuna contra estas enfermedades que, por fin, haga que el sacrificio valga la pena.
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