Para comenzar, necesitarás los programas mencoder y ffmpeg. Si no los tienes, puedes instalarlos abriendo una ventana de Consola (Aplicaciones > Accesorios > Terminal) y escribiendo lo siguiente:
sudo aptitude install mencoder ffmpeg
Ahora, si quieres convertir tu archivo ogv a formato avi, puedes conseguirlo escribiendo en la Consola:
mencoder entrada.ogv -ovc xvid -oac mp3lame -xvidencopts pass=1 -o salida.avi
Si lo que quieres obtener es un archivo en formato MJPEG, deberás escribir esto:
mencoder -idx entrada.ogv -ovc lavc -oac pcm -lavcopts vcodec=mjpeg -o salida.avi
Sin embargo, si lo que necesitas es convertir ogv a formato mpeg-2 deberás escribir:
mencoder -idx entrada.ogv -ovc lavc -oac lavc -lavcopts vcodec=mpeg2video -of mpeg -o salida.mpg
Y si quieres obtener un archivo compatible con MS-Windows mpeg-1, deberás escribir lo siguiente (donde -b 2500k indica el bitrate de salida):
ffmpeg -i entrada.ogv -b 2500k salida.mpg
Por último, si necesitas un archivo en formato FLV, para subirlo a Youtube y similares, puedes escribir lo siguiente (-s 640×480 es opcional e indica el tamaño del vídeo de salida):
ffmpeg -i entrada.ogv -s 640x480 salida.flv
Como puedes ver, si utilizar programas, como recordMyDesktop, que producen su salida en formato ogv, no debes sentirte limitado en absoluto, porque es muy fácil convertirlo en el formato que más te convenga.
http://sliceoflinux.com/2010/05/10/convertir-videos-en-formato-ogv-a-otros-formatos-de-forma-sencilla/