Un equipo de la Universidad Pablo de Olavide (UPO) de Sevilla va a presentar un proyecto de desarrollo de minimemorias biológicas (llamadas FlashBacter) en el marco del concurso iGEM de Biología sintética que tendrá lugar este verano en el MIT.
Desde el año 2004, el MIT (Instituto de Tecnología de Massachussets) organiza el concurso internacional iGEM (“International Genetically Engineered Machine”) con el objetivo de dar a conocer la Biología sintética. Esta competición está orientada a estudiantes universitarios, que han de trabajar durante todo el verano para desarrollar un proyecto en el que se utilicen técnicas de Biología sintética.
En el año 2010, el equipo UPO-Sevilla se convirtió en el primer equipo andaluz en formar parte de este concurso con su proyecto “Bacterial Crodwing”. El objetivo de ese proyecto fue explorar la posibilidad de dirigir una pequeña población de bacterias hacia una diana no difusible expuesta en una superficie biológica o abiótica para conseguir una interacción eficaz. El modelo experimental empleado fue Escherichia coli, la bacteria modelo por excelencia en Biología Molecular, como organismo transportador, y paredes celulares vegetales como diana. En un futuro se podría modificar el sistema para el reconocimiento de otro tipo de dianas (sustancias contaminantes, superficies de células cancerígenas, etc.). En esa primera toma de contacto se alcanzaron objetivos parciales, siendo éstos suficientes para llegar a ser presentados en el MIT. El equipo amplió el número de “biobricks” disponibles en el catálogo de partes biológicas y llegó a realizar construcciones genéticas con ellas, analizando el comportamiento quimiotáctico de las bacterias en estudio. Por otro lado, se implementó una simulación por ordenador de la evolución del sistema cuyos parámetros podían ser modificados por los usuarios para así acercarse más a las condiciones experimentales. Los modelos matemáticos que describían el proyecto fueron planteados y la mejor conclusión que se pudo sacar de ellos fue la robustez del sistema. El ocho de noviembre de 2010 en Boston, el equipo iGEM UPO-Sevilla recibió una medalla de bronce honorífica por este proyecto.
Este año el proyecto que presenta el equipo de la UPO se llama FlashBacter y su principal objetivo es la construcción de diminutas memorias biológicas. El almacenamiento de información en los ordenadores se realiza gracias a “biestables”, componentes electrónicos capaces de estar en dos estados, habitualmente denominados 0 y 1. En el núcleo del proyecto se encuentra la búsqueda de los sistemas moleculares que recreen mejor un biestable electrónico, acercándonos a la robustez de la informática y permitiéndonos la construcción de una pequeña memoria viva. La construcción de sistemas biológicos biestables es un tema candente en estos momentos en el que varios equipos iGEM han basado sus proyectos en ediciones anteriores. No obstante, los resultados positivos no han sido tan fáciles de alcanzar como se esperaba. El equipo UPO-Sevilla se plantea el diseño y construcción de sistemas biestables a distintos niveles de regulación biológica empleando varios organismos modelo, desde bacterias a levaduras. La comparación del funcionamiento de los distintos biestables biológicos permitirá servir de guía a futuros trabajos relacionados. Nos serviremos así de los conocimientos de la informática para mejorar los sistemas de control biológicos, de forma que podamos controlar el funcionamiento celular con mayor precisión.
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